叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
序一序二医之可法为问卷之一医学指南总诀二首卷之一本草第一药本五味一首药性指掌九十首妊娠服禁引经药报使六陈十八反(二首并出儒门事亲)十九畏(一首)用药法象(一首)卷之二脉诀第二诊脉入式(一首集次王适斋等
简介序卷01卷02卷03卷04卷05卷06卷07卷08卷09卷10卷11卷12卷13卷14卷15卷16卷17卷18卷19卷20卷21卷22卷23卷24
难经正义
序卷上总论指南赋入门察色五视法面上诸穴歌小儿无患歌调护歌入门候歌入门试法四十九脉图解详解脉纹辨色歌五指冷热歌审候歌脉法歌闻小儿声音辨小儿五音阳掌十八穴疗病诀阴掌九穴疗病诀附臂上五穴疗病诀足部十三穴疗病
序总论（共百字二十句五言）〔附一〕治眼九法〔附二〕茹穹子入道始终入手（一）身法得手进步入手（二）进步数息调息胎息丘真人呼吸歌
第1部分第2部分第3部分
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
卷上伤风伤寒中暑中湿风寒俱中内外伤寒一切汗候传染表证里证表里证汗后不解下后不解在上涌之在下泄之合病两感病头疼身疼腹胀满痛往来寒热潮热自汗自利并误下小便不利呕吐吐泻喘嗽渴烦躁懊虚烦不得眠留饮痞结胸血证谵
简介序卷一 内科卷二 妇人科卷三 小儿科卷四 外科卷五 通治