序宗旨医学色脉脉位脉象经络师传三十二则口问十二则问三焦命门脉问神门脉问冲阳太溪脉问反关脉问人迎气口脉问初诊久按不同说问病同脉异病异治同问从脉不从证从证不从脉问内经脉有阴阳说问高章纲卑损诸脉问辨声色法问
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
正文补编·卷上论温热病舌黄舌绛烟煤舌舌黑舌淡红无色舌白如粉验齿温热论补编·卷下崩漏标本证治崩漏虚实证治论妇女湿温病韩善征辟产后忌寒凉宜温热及大补气血论
药性歌括四百味
孙真人《千金方》论王唯一《明堂铜人灸经》量同身寸法第一正坐伸臂法第二揣骨定穴高下法第三定穴相去远近法第四钩股按穴取平法第五参验求穴法第六坐点坐灸法第七石用之取穴别法第八叶潘等取穴别法第九灸讫补养法第十
自叙卷上·经络脏腑无气存亡论躯壳经络脏腑论表里上下论阴阳升降论治病必分经络脏腑论治病不必分经络脏腑论肾藏精论一脏一腑先绝论君火相火论卷上·脉诊脉决死生论症脉轻重论脉症与病相反论卷上·病中风论臌膈论寒热
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分
电子版序郑钦安原序张仲景原序（校补）前言凡例伤寒恒论一百一十三方总目一百一十三方总目太阳上篇 计一十四方太阳中篇 计三十五方太阳下篇 计一十四方阳明上篇 计四方阳明中篇 计四方少阳篇 计二方合病篇 计
自序卷上 辨证瘴疟形状人身肖天地瘴疟类天时受病之源瘴疟伤寒辨瘴疟内伤辨诸疟瘴疟辨伤寒瘴疟分南北辨瘴疟五脏俱病冷瘴热瘴瘴不治症脉日期妇人小儿发瘴时调理却病法瘴病中将息法瘴病后将息法灸法瘴后变症痢肿胀痰治